動物科學技術學院前身為畜牧系，1950年4月，由國立西北農業專科學校畜牧科和草原科并入國立獸醫學院創建畜牧專業，隨后成立畜牧系。經學校批準，先后更名為動物生產工程系（1993年9月）、動物科學技術系 (1999年7月 )，2001年3月學校院系調整時成立動物科學技術學院。
    動物科學技術學院是我國高等農業院校中辦學歷史較長，并在國內外畜牧學界有著廣泛影響的學院。學院秉承老一輩“勤奮嚴謹、求實創新”的優良傳統，經過66年的建設與發展，已成為我國畜牧高級專業人才培養和科學研究的重要基地。學院設有動物營養與飼料科學系、動物遺傳育種與繁殖系、動物生產系、水產養殖系和動物科學技術實驗教學中心等教學機構，設甘肅省現代養豬工程技術研究中心、甘肅省草食動物生物技術重點實驗室、甘肅省牛羊基因改良工程實驗室、西北地區肉羊肉牛遺傳改良國際科技合作基地、甘肅農業大學永昌肉羊農科教合作人才培養基地和畜牧系統工程研究所等研究平臺。
     2001年經國家人事部批準設立畜牧學博士后科研流動站。2003 年經國務院學位委員會批準獲畜牧學一級學科博士學位授予權，下設二級學科（博士點）有：動物遺傳育種與繁殖、動物營養與飼料科學、特種經濟動物飼養和動物生產學。學院具有農業（畜牧領域）碩士專業學位授予權。動物遺傳育種與繁殖為農業部重點學科，畜牧學一級學科為甘肅省重點學科，動物科學專業為甘肅省特色專業。現開設動物科學、動物科學（畜牧獸醫方向）、水產養殖學3個本科專業和自學考試應用型獨立本科段（專升本）動物科學專業；學院為甘肅省飼料工業職業技能鑒定培訓考評基地。
    學院積極開展國內外學術交流，不斷提高辦學水平和人才培養質量。學院與美國、法國、德國、羅馬尼亞、澳大利亞、意大利、匈牙利、加拿大、新西蘭、土耳其、泰國、南非、肯尼亞、烏克蘭等10余個國家的大學和科研機構等開展學術交流與合作活動，與國內相關知名大學、研究單位及企業建有廣泛的聯系。學院現有10余家校外教學科研基地和大學生就業實踐基地。
    學院圍繞國家和地方經濟發展中的重大科技問題開展了廣泛的科學研究。66年來，學院廣大教師以嚴謹的治學態度和勤奮求實的精神，取得了顯著的教學、科研成果，獲得教學科研成果114項，發表學術論文1000余篇，主編、參編出版教材、著作101部。
    學院具有一支梯隊結構合理、學術水平優良、研究方向穩定且特色鮮明的師資隊伍。現有教職工51人，其中教授12人，副教授17人，講師12人，助教5人。博士生導師15人，碩士生導師38人，中青年教師已獲博士學位22人。先后有10多位教師榮獲國家級、省級榮譽稱號，享受政府特殊津貼6人，甘肅省優秀專家2人，甘肅省科技功臣1人。現有第六屆國務院學科評議組成員1人，教育部高等學校教學指導委員會委員2人，入選甘肅省“333”、“555”人才工程6人，甘肅省特聘科技專家2人，甘肅省領軍人才3人，國家現代農業產業技術體系崗位科學家2人，甘肅省飛天學者特聘教授、講座教授各1人。在全國學術團體任理事以上職務10多人。
    學院具有本科教育和研究生教育多層次、多學科的培養體系。66年來，學院已為社會培養各類專業人才9117人，其中博士研究生101人，碩士研究生739人，本科生3580人，專科生1203人，成人及自考本科生3494人，畢業生遍及海內外，涌現出如英國皇家科學院院士等大批專家、官員和企業家。目前學院有各類在讀學生2244人，其中，博士、碩士研究生157人，本科生967人，自考本科生1119人。