1956 年廣州中醫學院建校伊始就成立了體育教研室。在學校領導的關懷下，我校體育工作陪伴著學校發展在磨練中不斷成長。共同經歷了開創階段、十年文化大革命的停滯階段、改革探索階段和深化改革階段。經過幾代體育工作者的團結奮進和不懈努力，我校體育工作邁上了嶄新的臺階。 2003 年體育教研室由基礎醫學院下的一個教研室提升為學校的二級單位——體育部。 為滿足我國醫藥衛生事業以及體育事業發展的需要，進一步發揮我校醫體結合辦學資源優勢，由體育部牽頭，我校開始申報有醫體結合特色的“體育教育”新專業（保健體育與健康教育方向），并于 2005 年 3 月獲批。2006 年 11 月成立“體育健康學院”。2010年，正式獲得運動醫學碩士點。
體育健康學院下設黨政辦公室、學生工作辦公室、體育教研室、群體教研室、運動醫學教研室、理論教研室、學生體質監測研究室七個科室。承擔著全校公共體育教學、體育專業人才的培養、學生日常管理、學生體質健康標準測定、群體競賽活動開展、高水平運動隊伍培養、校園體育文化建設、體育科學研究、體育場館的建設與維護工作。在學校建設中發揮著日益重要的作用。
從 2005 年招生伊始，我們就一直堅持貫徹醫體結合、凸顯特色、文體并重、全面發展的素質教育人才培養理念。雖然新專業在發展過程中遇到問題和困難，但是全院上下群策群力，給學生營造了一個良好的成長成才環境。建院時間雖短，但在校內各種體育競賽、演講比賽、講課大賽、文藝演出等活動中，都留下體育健康學院學子矯健的身影和奪人的風采。目前，學院現有體育專業本科學生470人。擁有體育教師36名，教輔人員 1 名，專職輔導員 2 名。其中正教授2人，副教授 10 名，講師 20 名，助教 5 名。博士 2 人，碩士 18 人?，F有碩士生導師7人，共招收11名碩士研究生。我院教師獲得國家健將級運動員稱號 2 人，國家一級運動員 3 人，國家級裁判 3 人，國家一級裁判 9 人。
體育健康學院的成立，為我校體育事業的發展帶來了契機，同時，也面臨著來自各方面的嚴峻挑戰。怎樣使學校體育在我校“學科交叉、資源共享”的優勢中拓展新的發展空間，培育新的增長點；怎樣在“內聚人心、外塑形象”中，發揮更大的作用。面對重重困難和問題，我們必須深刻理解和準確把握時代發展的大趨勢，以本科教學評估為動力，解放思想，大膽創新，搶抓機遇，干事創業，努力把具有中醫特色的學校體育工作全面推向新階段。